MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus N315 plasmid pN315

Total Repeats: 650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003140	TAA	2	6	14	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003140	ACT	2	6	42	47	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_003140	TAA	2	6	67	72	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003140	TTTA	2	8	88	95	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003140	TA	3	6	94	99	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003140	TAT	2	6	114	119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003140	AAT	2	6	126	131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003140	TAAA	2	8	157	164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003140	TAAA	2	8	173	180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003140	TTA	2	6	187	192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003140	T	6	6	223	228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003140	AAAG	2	8	268	275	75 %	0 %	25 %	0 %	16119201
13	NC_003140	CTAA	2	8	325	332	50 %	25 %	0 %	25 %	16119201
14	NC_003140	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119201
15	NC_003140	A	6	6	463	468	100 %	0 %	0 %	0 %	16119201
16	NC_003140	A	7	7	486	492	100 %	0 %	0 %	0 %	16119201
17	NC_003140	ACG	2	6	525	530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119201
18	NC_003140	TAAA	2	8	536	543	75 %	25 %	0 %	0 %	16119201
19	NC_003140	AGA	2	6	606	611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119201
20	NC_003140	AAT	2	6	772	777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119201
21	NC_003140	ATGA	2	8	781	788	50 %	25 %	25 %	0 %	16119201
22	NC_003140	TGA	2	6	861	866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119201
23	NC_003140	AAC	2	6	896	901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119201
24	NC_003140	ATT	2	6	908	913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119201
25	NC_003140	A	7	7	969	975	100 %	0 %	0 %	0 %	16119201
26	NC_003140	CTT	2	6	1040	1045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119201
27	NC_003140	A	6	6	1057	1062	100 %	0 %	0 %	0 %	16119201
28	NC_003140	GAA	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119201
29	NC_003140	AATAT	2	10	1193	1202	60 %	40 %	0 %	0 %	16119201
30	NC_003140	AAT	2	6	1211	1216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119201
31	NC_003140	ATC	2	6	1264	1269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119202
32	NC_003140	TGA	2	6	1282	1287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119202
33	NC_003140	CGA	2	6	1288	1293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119202
34	NC_003140	A	7	7	1293	1299	100 %	0 %	0 %	0 %	16119202
35	NC_003140	TGG	2	6	1357	1362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119202
36	NC_003140	TGA	2	6	1432	1437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119202
37	NC_003140	GAA	2	6	1454	1459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119202
38	NC_003140	A	7	7	1458	1464	100 %	0 %	0 %	0 %	16119202
39	NC_003140	ATT	3	9	1505	1513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119202
40	NC_003140	T	7	7	1539	1545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003140	A	6	6	1559	1564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003140	TGTA	2	8	1592	1599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003140	TTAAA	2	10	1740	1749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003140	A	6	6	1859	1864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003140	TTTG	2	8	1889	1896	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003140	AT	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003140	TAA	2	6	2034	2039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003140	GA	3	6	2061	2066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003140	AC	3	6	2167	2172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_003140	TA	3	6	2183	2188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003140	T	6	6	2201	2206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003140	ATAA	2	8	2213	2220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003140	A	6	6	2241	2246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003140	GAA	2	6	2261	2266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003140	CCG	2	6	2443	2448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119203
56	NC_003140	AGT	2	6	2480	2485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119203
57	NC_003140	TAC	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119203
58	NC_003140	TAA	2	6	2609	2614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119203
59	NC_003140	CTT	2	6	2644	2649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119203
60	NC_003140	T	6	6	2648	2653	0 %	100 %	0 %	0 %	16119203
61	NC_003140	T	7	7	2672	2678	0 %	100 %	0 %	0 %	16119203
62	NC_003140	AT	3	6	2691	2696	50 %	50 %	0 %	0 %	16119203
63	NC_003140	T	6	6	2723	2728	0 %	100 %	0 %	0 %	16119203
64	NC_003140	TTA	2	6	2743	2748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119203
65	NC_003140	TCT	2	6	2815	2820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119203
66	NC_003140	T	7	7	2828	2834	0 %	100 %	0 %	0 %	16119203
67	NC_003140	CTT	2	6	2840	2845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119203
68	NC_003140	T	6	6	2844	2849	0 %	100 %	0 %	0 %	16119203
69	NC_003140	TTTC	2	8	2912	2919	0 %	75 %	0 %	25 %	16119203
70	NC_003140	T	6	6	2987	2992	0 %	100 %	0 %	0 %	16119203
71	NC_003140	TTC	2	6	2994	2999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119203
72	NC_003140	ATT	2	6	3052	3057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119203
73	NC_003140	AAT	2	6	3061	3066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119203
74	NC_003140	ATA	2	6	3095	3100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003140	TAAG	2	8	3117	3124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003140	ATTT	2	8	3142	3149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003140	AT	3	6	3152	3157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003140	ATGA	2	8	3190	3197	50 %	25 %	25 %	0 %	16119204
79	NC_003140	AT	3	6	3210	3215	50 %	50 %	0 %	0 %	16119204
80	NC_003140	T	6	6	3271	3276	0 %	100 %	0 %	0 %	16119204
81	NC_003140	TGA	2	6	3288	3293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119204
82	NC_003140	T	7	7	3308	3314	0 %	100 %	0 %	0 %	16119204
83	NC_003140	AAAG	2	8	3374	3381	75 %	0 %	25 %	0 %	16119204
84	NC_003140	AAT	2	6	3392	3397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003140	TAGAT	2	10	3447	3456	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003140	T	7	7	3463	3469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003140	TCT	2	6	3490	3495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_003140	TTTTTG	2	12	3628	3639	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003140	AT	3	6	3648	3653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003140	AT	3	6	3684	3689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003140	A	6	6	3765	3770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003140	TTTC	2	8	3803	3810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_003140	TATT	2	8	3819	3826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003140	TTTC	2	8	3827	3834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_003140	TCG	2	6	3844	3849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_003140	A	6	6	3859	3864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003140	GTA	2	6	3902	3907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003140	AATT	2	8	3923	3930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003140	A	7	7	3978	3984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003140	CGA	2	6	3986	3991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_003140	ACG	2	6	4067	4072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_003140	TTAT	2	8	4146	4153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003140	TAA	2	6	4183	4188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003140	GAA	2	6	4309	4314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003140	ATT	2	6	4444	4449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003140	TAT	2	6	4497	4502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119205
107	NC_003140	GTT	2	6	4513	4518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119205
108	NC_003140	GCT	3	9	4519	4527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119205
109	NC_003140	CAG	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119205
110	NC_003140	TTA	2	6	4555	4560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119205
111	NC_003140	TTA	2	6	4567	4572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119205
112	NC_003140	T	6	6	4576	4581	0 %	100 %	0 %	0 %	16119205
113	NC_003140	TAT	2	6	4641	4646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119205
114	NC_003140	TTAG	2	8	4654	4661	25 %	50 %	25 %	0 %	16119205
115	NC_003140	ATG	2	6	4760	4765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119205
116	NC_003140	AG	3	6	4781	4786	50 %	0 %	50 %	0 %	16119205
117	NC_003140	A	6	6	4789	4794	100 %	0 %	0 %	0 %	16119205
118	NC_003140	TGAA	2	8	4799	4806	50 %	25 %	25 %	0 %	16119205
119	NC_003140	ATA	2	6	4868	4873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119205
120	NC_003140	TTAC	2	8	4921	4928	25 %	50 %	0 %	25 %	16119205
121	NC_003140	TAATTT	2	12	4943	4954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119205
122	NC_003140	TCT	2	6	4955	4960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119205
123	NC_003140	TTG	2	6	5009	5014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119205
124	NC_003140	TAT	2	6	5040	5045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119205
125	NC_003140	TA	3	6	5047	5052	50 %	50 %	0 %	0 %	16119205
126	NC_003140	TTTA	2	8	5061	5068	25 %	75 %	0 %	0 %	16119205
127	NC_003140	TTA	3	9	5066	5074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119205
128	NC_003140	TGTGA	2	10	5155	5164	20 %	40 %	40 %	0 %	16119206
129	NC_003140	T	6	6	5202	5207	0 %	100 %	0 %	0 %	16119206
130	NC_003140	AGA	2	6	5208	5213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119206
131	NC_003140	A	6	6	5246	5251	100 %	0 %	0 %	0 %	16119206
132	NC_003140	TGA	2	6	5256	5261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119206
133	NC_003140	GAA	2	6	5262	5267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119206
134	NC_003140	AGA	2	6	5295	5300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119206
135	NC_003140	TG	3	6	5306	5311	0 %	50 %	50 %	0 %	16119206
136	NC_003140	CAT	2	6	5359	5364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119206
137	NC_003140	TA	3	6	5375	5380	50 %	50 %	0 %	0 %	16119206
138	NC_003140	ATT	2	6	5423	5428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119206
139	NC_003140	TTA	2	6	5429	5434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119206
140	NC_003140	AG	3	6	5449	5454	50 %	0 %	50 %	0 %	16119206
141	NC_003140	TCT	2	6	5493	5498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_003140	A	6	6	5513	5518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003140	TA	3	6	5525	5530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003140	GAC	2	6	5537	5542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_003140	TAA	2	6	5582	5587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119207
146	NC_003140	TC	3	6	5600	5605	0 %	50 %	0 %	50 %	16119207
147	NC_003140	AG	3	6	5622	5627	50 %	0 %	50 %	0 %	16119207
148	NC_003140	CAT	2	6	5661	5666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119207
149	NC_003140	TCA	2	6	5675	5680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119207
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153	NC_003140	TAAT	2	8	5731	5738	50 %	50 %	0 %	0 %	16119207
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281	NC_003140	AATAT	2	10	10692	10701	60 %	40 %	0 %	0 %	16119212
282	NC_003140	A	6	6	10707	10712	100 %	0 %	0 %	0 %	16119212
283	NC_003140	AAG	2	6	10756	10761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119212
284	NC_003140	TA	3	6	10798	10803	50 %	50 %	0 %	0 %	16119212
285	NC_003140	A	6	6	10803	10808	100 %	0 %	0 %	0 %	16119212
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421	NC_003140	ATAA	3	12	16471	16482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_003140	TTA	2	6	16557	16562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119219
423	NC_003140	AAGCTG	2	12	16576	16587	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16119219
424	NC_003140	TGG	2	6	16604	16609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119219
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428	NC_003140	AAACA	2	10	16769	16778	80 %	0 %	0 %	20 %	16119219
429	NC_003140	AT	3	6	16801	16806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_003140	A	6	6	16874	16879	100 %	0 %	0 %	0 %	16119220
431	NC_003140	ATT	2	6	16885	16890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119220
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442	NC_003140	TTA	2	6	17186	17191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119220
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444	NC_003140	TAT	2	6	17213	17218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119220
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448	NC_003140	ATT	2	6	17311	17316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119220
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454	NC_003140	ATA	2	6	17469	17474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119220
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463	NC_003140	AT	4	8	17802	17809	50 %	50 %	0 %	0 %	16119220
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465	NC_003140	AGA	2	6	17881	17886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119220
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467	NC_003140	TTAA	2	8	17918	17925	50 %	50 %	0 %	0 %	16119220
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472	NC_003140	ATAAA	2	10	18093	18102	80 %	20 %	0 %	0 %	16119220
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499	NC_003140	A	6	6	19326	19331	100 %	0 %	0 %	0 %	16119222
500	NC_003140	ATTTAG	2	12	19412	19423	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16119222

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